剑桥大学的病毒进化图谱能让我们得到什么结论？

Charles 杨

最近一篇发表在PNAS 的论文研究了COVID 19 的进化图谱，显示出ABC三个重要分支分别在美国、中国和欧洲流行。那么这篇文章是否可信？我们从文章中又能得出什么结论呢？

首先，文章是地区存在的，原文标题是：Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes， 作者共 4位： Peter Forster,  Lucy Forster, Colin Renfrew, Michael Forster， 第一作者同时兼职德国基因研究机构和剑桥大学，
文章2020年4月8日发表于PNAS，链接 https://doi.org/10.1073/pnas.2004999117


其次，我们能得到什么结论？


首先，作者谈了一下研究方法，这种方法叫做系统进化网络图谱， 这种基于线粒体和Y染色体数据的网络方法使我们能够重建和理解理解冠状病毒
的进化过程。

作者们在对160个完整的人类严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2（SARS-Cov-2）基因组进行的系统进化网络分析中，我们发现了三个主要的变异体，
它们的氨基酸变化不同，我们将其命名为A，B和C，其中A为根据蝙蝠的外祖先型冠状病毒。 A和C类型在东亚以外地区（即欧洲人和美国人中）
的比例很高。相比之下，B型是东亚最常见的类型，该网络忠实地跟踪了记录在案的冠状病毒病2019（COVID-19）病例的感染途径，这表明系
统进化网络同样可以成功地用于帮助跟踪未记录的COVID-19感染源，然后可以对其进行隔离以防止疾病复发全世界。


通过对原文及图谱的分析，我们可以得到以下结论：
1. 病毒在传播中不断变异和进化。
2. 传播途径是复杂的，反映了现代社会人员流动的复杂性。
3. 病毒的最初来源和蝙蝠分离出的病毒具有高度同源性。
4. 美欧亚三个地区对病毒ABC三个分支都有感染，但流行的种类似乎有所侧重。即美国A分支多一点，亚洲B分支多一点，欧洲C分支多一点。


但是，我们无法得到以下结论：1. 中国的病毒来自美国。2. 哪一分支具有更强传染性。 3.某一分支会消失。